Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc178Q8CDV0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc178Q8CDV0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms