Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms