Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp8Q80U87 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp8Q80U87 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp8Q80U87 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp8Q80U87 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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