Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1bQ7TSF1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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