Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ScocQ78YZ6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ScocQ78YZ6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ScocQ78YZ6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ScocQ78YZ6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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