Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctnna3Q65CL1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnna3Q65CL1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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