Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tbr1Q64336 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tbr1Q64336 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms