Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf1Q64213 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf1Q64213 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf1Q64213 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf1Q64213 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf1Q64213 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sf1Q64213 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sf1Q64213 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms