Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Zfp248Q640N4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp248Q640N4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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