Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxj1Q61660 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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