Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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