Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms