Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gse1Q3U3C9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms