Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms