Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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