Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms