Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ap5b1Q3TAP4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms