Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Colec11Q3SXB8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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