Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms