Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cntn3Q07409 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cntn3Q07409 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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