Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms