Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms