Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms