Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col1a2Q01149 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms