Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms