Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcc1P97496 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms