Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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