Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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