Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irf5P56477 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms