Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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