Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb4P54761 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms