Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dbx1P52950 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dbx1P52950 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms