Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms