Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtgfrP43117 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms