Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Psmb8P28063 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms