Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
NdnP25233 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NdnP25233 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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NdnP25233 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms