Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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