Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3aP23116 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms