Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pou5f1P20263 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou5f1P20263 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms