Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Csn1s1P19228 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Csn1s1P19228 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Csn1s1P19228 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csn1s1P19228 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Csn1s1P19228 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csn1s1P19228 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csn1s1P19228 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms