Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18528 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18528 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms