Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc6P10629 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hoxc6P10629 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc6P10629 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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