Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ifna4P07351 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms