Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfdp1O88271 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfdp1O88271 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms