Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AurkbO70126 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkbO70126 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms