Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Casq1O09165 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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