Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LhbO09108 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LhbO09108 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms