Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm379J3QQ19 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms