Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms