Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M1F7CXU4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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H2-M1F7CXU4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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H2-M1F7CXU4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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H2-M1F7CXU4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
H2-M1F7CXU4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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